實驗室凈化工程主要是通過人為的手段，使用凈化技能完成操控室內空氣中塵土、含菌濃度、溫濕度與壓力、以達到所要求的凈化度、溫濕度和氣流速度等環境參數。

空氣凈化度是指凈化空氣環境中空氣含塵量程度，空氣凈化度的級別以含塵濃度區分。凈化度是指每升空氣中所含粒徑≥0.5um的塵粒的總顆粒。我國空氣凈化等級標準分為：100級、1000級、10000級、100000級。國際標準則區分為：1級、2級、3級、4級、5級。

實驗凈化室一般施行兩級阻隔，一級阻隔通過生物安全柜、負壓阻隔器、正壓防護服、手套、眼罩等完成;二級阻隔通過實驗室的建筑、空調凈化和電氣操控系統來完成。但由于凈化空調需要風量小為了安全起見，風量都按大的估算，一般都要超越規范規定，物別是百級以上，冷熱負荷在要求不是很嚴格的狀況可能估算，現在專門有凈化空調機組，可以直接利用。二級~四級生物安全實驗室應施行兩級阻隔。一般實驗室配備有:超凈作業臺、生物安全柜、邊臺或不銹鋼操作臺、洗滌臺等。

以PCR實驗室為例(PCR即聚合酶鏈式反響)，是分子生物學研討和實驗的常規辦法，也是生物學、醫學臨床等范疇廣泛使用的實驗技能。其特點是能將微量的DNA大幅添加，實驗室一般分為四個區域，即：試劑貯存和預備區、標本制備區、擴增反響混合物制造和擴增區、擴增產品剖析區(如使用全自動剖析儀，區域可適當合并)。進入各個區域有必要嚴格按照單一方向進行，不同的作業區域使用不同的作業服(例如不同的色彩)。作業人員離開時，不得將作業服帶出。

實驗室凈化工程，試劑貯存和預備室(標本制備區)，儀器主要配置有：冷凍離心機、生物安全柜、冰箱、可移動紫外燈、全自動力核酸蛋白純化儀、專用作業服和作業鞋等。擴增反響混合物制造和擴增區配置有：冰箱、高速離心機、超凈作業臺、PCR儀(要求負壓狀況)、可移動紫外燈、微量加樣器、核酸擴增儀等。擴增產品剖析區主要配置有：移液器、振蕩器、超凈作業臺、毛細管電泳儀、冰箱、離心機、微量加樣器、可移動紫外燈等。